卫生部已备妥85支紧急医疗队、共387名人员，以应对2026/2027年东北季候风季节可能发生的水灾。
卫生部周一（11月9日）发文告说，这些队伍包括36支快速评估及卫生快速应对队、34支医疗快速应对队，以及15支心理健康与心理社会支援队，将视需要出动，进行健康风险评估、提供医疗服务及紧急治疗、监测及控制传染病，并为水灾灾民提供心理健康及心理社会支援。
卫生部说，当局已准备128辆车辆，以协助调动人员及支援现场行动；由特许供应商管理的仓库内，与水灾相关的药物存货稳定，估计足以应付一至三个月。
该部的国家危机准备与应对中心自10月27日起已进入警戒状态，持续监测水灾情况及医疗设施的准备工作，并与各州卫生局及其他机构协调。当局已确认有水灾风险的医疗设施，并安排了替代设施以防服务中断，同时也制定计划，提早转移孕妇及需要洗肾的高风险病人。
在临时疏散中心，医疗队伍将进行健康检查、传染病监测、卫生检查、食物与饮水安全检查及病媒控制，以减少腹泻、食物中毒、钩端螺旋体病（老鼠尿病）及呼吸道感染等与水灾相关的疾病。
卫生部说，截至周一早上6时，雪兰莪和霹雳发生水灾，共有283户987人被安置在7个临时疏散中心。雪州水灾灾户也将获得额外2500令吉援助。大马气象局预计本季会出现三至五次季候风潮，可能为半岛东部和南部、沙巴东部以及砂拉越西部和南部带来大雨；卫生部警告，若长时间降雨遇上大潮，水灾风险将会升高。
卫生部促请民众饮用干净安全的水、食用煮熟的食物、避免食用可能受洪水污染的食物、经常用肥皂和清水洗手，并避免直接接触洪水。若在接触洪水后出现发烧、腹泻、呕吐或肌肉疼痛，应立即到医疗设施求诊。慢性病患者、乐龄人士、孕妇和儿童应继续接受治疗，并备足药物，以防需要撤离到疏散中心。